UTFaculteitenEEMCSDisciplines & departementenDMBAssignmentsOpen AssignmentsOpen Master Assignments[D] Natural Language Processing for diagnosis of patients with unexplainable Left Ventricle Hypertrofia

[D] Natural Language Processing for diagnosis of patients with unexplainable Left Ventricle Hypertrofia

Master Assignment

Natural Language Processing for diagnosis of patients with unexplainable Left Ventricle Hypertrofia 

Type: Master CS/TM

Location: UMC Utrecht

Period: TBD

Student: (Unassigned)

If you are interested please contact :

Dr.M. Oerlemans
cardiologist UMC Utrecht

Goal:

Improve the detection of rare infiltrative heart diseases such as LVH, CA and Fabry based on data from patients' health records. Target data is multimodal: ultrasound imaging, ECG signals, unstructured text. 

Explanation of medical context: (apologies for the Dutch description):

Linkerventrikelhypertrofie (LVH) wordt gekenmerkt door een toegenomen linkerventrikel wanddikte waarbij onderliggend meestal sprake is van een abnormale belasting (hypertensie, hartkleplijden, aortaklepstenose). In afwezigheid hiervan is er sprake van een hypertrofische cardiomyopathie (HCM, 0,02 - 0,23% van de volwassenen) waarbij 60% een autosomaal dominante mutatie in sarcomeergenen heeft2. Zeldzamere oorzaken zijn uiteenlopend, maar infiltratieve ziekten zoals cardiale amyloïdose (CA) en metabole ziekten (ziekte van Fabry) vormen de belangrijkste.2,3 

Voor CA, waarbij voorloper eiwitten amyloïd deposities, is veel belangstelling ontstaan vanwege verbeterde diagnostiek en recent toegenomen behandelopties. Bij AL amyloïdose is er sprake van overmatige immuunglobuline productie door plasmacellen in het beenmerg, waardoor chemotherapie de aangewezen behandeling is. Bij ATTR amyloïdose is er sprake van overmatig circulerend transthyretine (TTR) eiwit door ouderdom of een mutatie in het TTR gen. Er zijn twee nieuwe medicijnen op de markt verschenen met veelbelovende resultaten in recente trials.  

De infiltratieve amyloïd afzettingen leiden tot progressieve linker (en rechter)kamer hypertrofie, diastolische disfunctie en uiteindelijk hartfalen gekenmerkt door zeer uitgesproken LVH.

Vroege diagnose is cruciaal om op tijd de onderliggende behandeling te kunnen starten aangezien de gemiddelde overleving significant daalt als er sprake is van vergevorderde cardiale aantasting. Epidemiologische data suggereert dat er een belangrijk aantal patiënten met onverklaarde LVH rondloopt, waarbij onderliggend CA of Fabry speelt.